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PDB format protein structure with one chain

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新生蛋

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发表于 2018-7-6 16:10:57 | 显示全部楼层 |阅读模式

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在用COFACTOR server软件时,要求“input PDB format protein structure with one chain”,请问怎么可以把已有的序列转化为PDB format protein structure with one chain
360截图20180706160518381.jpg
[发帖际遇]: 蛋黄蛋清蛋白实验记录写的一丝不苟,蛋白质科学网奖励2 贡献,并带来爱迪生的话“良好的实验记录,是灵感的来源”. 幸运榜 / 衰神榜
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发表于 2018-7-6 22:34:08 | 显示全部楼层
这就需要是解析了的结构或者是预测出来的三级结构,解析的结构去RCSB下载,预测的可去swiss-model去building 一个。
[发帖际遇]: DH5a 刚刚帮助警察抓小偷了,被奖励 7 贡献. 幸运榜 / 衰神榜
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发表于 2018-7-6 22:34:14 | 显示全部楼层
这就需要是解析了的结构或者是预测出来的三级结构,解析的结构去RCSB下载,预测的可去swiss-model去building 一个。
[发帖际遇]: DH5a 发帖时在路边捡到 3 蛋蛋,偷偷放进了口袋. 幸运榜 / 衰神榜
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发表于 2018-7-6 22:34:56 | 显示全部楼层
肯定是没法直接转换的,要去下载或者自己build
[发帖际遇]: DH5a做科研想象力十足,蛋白质科学网奖励7 贡献,采访TA时,TA说”天才就是我这样的,1%的努力,加上99%的灵感“. 幸运榜 / 衰神榜
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发表于 2018-7-9 09:15:02 | 显示全部楼层
去 protein data bank里下载pdb格式的三维结构
[发帖际遇]: jhtjs2015 做实验很认真,蛋白质科学网奖励其 10 贡献. 幸运榜 / 衰神榜
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 楼主| 发表于 2018-7-23 16:26:30 | 显示全部楼层
jhtjs2015 发表于 2018-7-9 09:15
去 protein data bank里下载pdb格式的三维结构

懂了,谢谢
[发帖际遇]: 蛋黄蛋清蛋白昨天上厕所没洗手,有关部门扣其 5 蛋蛋. 幸运榜 / 衰神榜
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 楼主| 发表于 2018-7-23 16:27:13 | 显示全部楼层
DH5a 发表于 2018-7-6 22:34
这就需要是解析了的结构或者是预测出来的三级结构,解析的结构去RCSB下载,预测的可去swiss-model去buildin ...

谢谢,我去试试
[发帖际遇]: 蛋黄蛋清蛋白 科研决心很坚决,在不利的环境下依然坚持查阅文献,人民很感动,科技部奖励励 1 贡献. 幸运榜 / 衰神榜
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