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pymol作图某细节的放大

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发表于 2017-12-31 15:56:41 | 显示全部楼层 |阅读模式

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     大家好,上来请教pymol作图的问题,比如我想把某些helix拎出来放大,怎么操作呢?做成类似下图的样子:非常感谢!
1.png
[发帖际遇]: clear 做实验很认真,蛋白质科学网奖励其 6 贡献. 幸运榜 / 衰神榜
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 楼主| 发表于 2018-2-1 18:00:18 | 显示全部楼层
搞清楚啦,用set cartoon_transparency,0.5,object,透明和不透明的重叠1-2残基,就不会有断裂的情况
[发帖际遇]: clear 乐于助人,奖励 10 贡献. 幸运榜 / 衰神榜
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发表于 2018-1-1 09:02:53 | 显示全部楼层
我理解的就是放大后输出一张slice再作图就好啊
[发帖际遇]: xtalman 发表论文了,大家奖励其 2 贡献,并“喜大普奔”. 幸运榜 / 衰神榜
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发表于 2018-1-1 09:04:14 | 显示全部楼层
右图就是突出目标部分,其他部分透明度设置为高透明度了吧
[发帖际遇]: xtalman 发表论文了,大家奖励其 9 贡献,并“喜大普奔”. 幸运榜 / 衰神榜
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发表于 2018-1-1 09:04:27 | 显示全部楼层
右图就是突出目标部分,其他部分透明度设置为高透明度了吧
[发帖际遇]: xtalman最近心情不好,蛋白质科学网代表祖国发来慰问金9 贡献,并带来主席的话“忘记昨天,每一个今天都是新的起跑线”. 幸运榜 / 衰神榜
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 楼主| 发表于 2018-1-1 17:43:58 | 显示全部楼层
xtalman 发表于 2018-1-1 09:04
右图就是突出目标部分,其他部分透明度设置为高透明度了吧

是的,我想请问只设置部分cartoon的透明度怎么设置呢?谢谢!
[发帖际遇]: clear 被钱袋砸中进医院,看病花了 5 蛋蛋. 幸运榜 / 衰神榜
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发表于 2018-1-2 00:18:33 | 显示全部楼层
这个帖子基本上可以做到大多数动画要求,http://www.proteinscience.cn/for ... thread&tid=1179
[发帖际遇]: muheifeng最近心情不好,蛋白质科学网代表祖国发来慰问金3 贡献,并带来主席的话“忘记昨天,每一个今天都是新的起跑线”. 幸运榜 / 衰神榜
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发表于 2018-1-2 00:20:25 | 显示全部楼层
muheifeng 发表于 2018-1-2 00:18
这个帖子基本上可以做到大多数动画要求,http://www.proteinscience.cn/forum.php?mod=viewthread&tid=1179 ...

你自己去理会用吧,举的“栗子”是很简单的动画,复制的也都能做出来,可见论坛中其他贴有提到
[发帖际遇]: 一个袋子砸在了 muheifeng 头上,muheifeng 赚了 4 蛋蛋. 幸运榜 / 衰神榜
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发表于 2018-1-15 16:40:18 | 显示全部楼层
clear 发表于 2018-1-1 17:43
是的,我想请问只设置部分cartoon的透明度怎么设置呢?谢谢!

setting-transpaerence-cartoon-50%
[发帖际遇]: chenjinli2031 一个月就解出了一个蛋白质结构,大家共同奖励其 5 贡献,并表示“哎,不明觉厉啊!”. 幸运榜 / 衰神榜
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