蛋白质科学网

 找回密码
 注册
查看: 51|回复: 4
收起左侧

如何在pymol里面把β-sheet显示出来

[复制链接]

2

主题

4

帖子

1154

积分

水蛋

Rank: 3Rank: 3

积分
1154
发表于 2017-9-24 16:21:07 | 显示全部楼层 |阅读模式

马上注册,共享更多资源。

您需要 登录 才可以下载或查看,没有帐号?注册

x
有时候结构的β-sheet未能在pymol里面有效的显现出来,这样怎么样做能把它再现出来呢

谢谢
[发帖际遇]: piao 发帖时在路边捡到 1 蛋蛋,偷偷放进了口袋. 幸运榜 / 衰神榜
回复

使用道具 举报

6

主题

328

帖子

8万

积分

版主

Rank: 7Rank: 7Rank: 7

积分
82557
QQ
发表于 2017-9-27 10:19:47 | 显示全部楼层
自定义某一段多肽为特定的二级结构就可以了
[发帖际遇]: jhtjs2015 科研决心很坚决,在不利的环境下依然坚持查阅文献,人民很感动,科技部奖励励 7 贡献. 幸运榜 / 衰神榜
回复 支持 反对

使用道具 举报

2

主题

4

帖子

1154

积分

水蛋

Rank: 3Rank: 3

积分
1154
 楼主| 发表于 2017-9-27 11:07:45 | 显示全部楼层
jhtjs2015 发表于 2017-9-27 10:19
自定义某一段多肽为特定的二级结构就可以了

感谢回复。

请问一下怎么自定义啊 ,能否把命令说一下哦 谢谢了  麻烦你了
[发帖际遇]: piao 非常用功读书,蛋白质科学网代表主席奖励其 3 贡献,并表示“为中华崛起而读书”. 幸运榜 / 衰神榜
回复 支持 反对

使用道具 举报

6

主题

328

帖子

8万

积分

版主

Rank: 7Rank: 7Rank: 7

积分
82557
QQ
发表于 2017-9-28 09:28:14 | 显示全部楼层
piao 发表于 2017-9-27 11:07
感谢回复。

请问一下怎么自定义啊 ,能否把命令说一下哦 谢谢了  麻烦你了

show cartoon
alter 11-40/, ss='H'             # assign residues 11-40 as helix
alter 40-52/, ss='L'             # assign residues 40-52 as loop
alter 52-65/, ss='S'             # assign residues 52-65 as sheet
alter 65-72/, ss='H'             # assign residues 65-72 as helix
rebuild                          # regenerate the cartoon

[发帖际遇]: 一个袋子砸在了 jhtjs2015 头上,jhtjs2015 赚了 4 蛋蛋. 幸运榜 / 衰神榜
回复 支持 反对

使用道具 举报

0

主题

3

帖子

516

积分

水蛋

Rank: 3Rank: 3

积分
516
发表于 2017-9-29 14:45:39 | 显示全部楼层
[发帖际遇]: bubuamanda 发帖时在路边捡到 2 蛋蛋,偷偷放进了口袋. 幸运榜 / 衰神榜
回复

使用道具 举报

您需要登录后才可以回帖 登录 | 注册

本版积分规则

QQ|Archiver|手机版|蛋白质科学网 ( 沪ICP备15022641号

GMT+8, 2017-10-23 08:51 , Processed in 0.390897 second(s), 36 queries .

Powered by Discuz! X3.2

© 2001-2013 Comsenz Inc.

快速回复 返回顶部 返回列表